Nieuwe methode voor het identificeren van olijfcultivars

Een nieuwe semi-automatische methodologie voor het identificeren van olijfcultivars op basis van het uiterlijk van bladeren en fruit is bedoeld als basis voor een telefoonapp voor producenten en bijdragen aan een nieuwe internationale olijfboomdatabase, aldus Konstantinos Blazakis, een onderzoeker die samenwerkt met Panagiotis Kalaitzis van de afdeling Tuinbouwgenetica en biotechnologie aan het Mediterrane Agronomisch Instituut van Chania (MAICh) op Kreta, Griekenland.

Blazakis hoopt dat een toepassing van deze nieuwe methode een app voor mobiele telefoons zal zijn die de cultivar kan identificeren op basis van een foto van een olijfvrucht, blad of endocarpium. Hij verwacht binnen een jaar of twee te starten met Griekse cultivars en hoopt later ondersteuning te krijgen om als aanvullend project internationale cultivars aan deze app toe te voegen. Hij geeft toe dat de app voor mobiele telefoons waarschijnlijk het nuttigst zal zijn in landen met veel verschillende olijvenrassen, omdat boeren zeker willen weten welke cultivar ze hebben.

Een ander doel van Blazakis is bij te dragen aan een nieuwe internationale online database die informatie zal catalogiseren over onder meer het uiterlijk en de chemische analyse van olijfvariëteiten wereldwijd. Hij zei dat vijftien partners uit een aantal landen samenwerken om deze gebruiksvriendelijke database voor het grote publiek voor te bereiden, die zal worden ​"gebaseerd op de genetische, fysiologische, moleculaire en morfologische studie van elke cultivar. " De onderzoekers zijn van plan om eerdere gegevens op te nemen, dubbel gecontroleerd op juistheid, en om nieuwe informatie toe te voegen.

Dit maakt deel uit van het brede, ambitieuze project Bioresources For Oliviculture, of BeFOre, dat wordt gefinancierd door de Europese Unie. Horizon 2020 onderzoeks- en innovatieprogramma in het kader van de Marie Skłodowska-Curie-subsidieovereenkomst en wordt ook ondersteund door de Internationale Olijfraad.

Voorwaar is ​"gericht op het opzetten van geïntegreerde gemeenschappelijke protocollen om planten te fenotyperen en karakteriseren op moleculair, morfologisch en fysiologisch niveau, en op het evalueren van de kwaliteit van olijfolie met betrekking tot variëteiten, "aldus zijn website, ​"verwacht het potentieel van de Olive Germplasm-collecties, opslagplaatsen en banken te verbeteren als belangrijkste bronnen van variabiliteit en van evaluatie-instrumenten die kunnen worden gebruikt om de duurzaamheid van de olivicultuur te vergroten en om bestaande en opkomende problemen het hoofd te bieden. "

Blazakis benadrukt het belang van het evalueren en karakteriseren van de diversiteit van olijvensoorten om de rijke verscheidenheid aan genetische bronnen met al hun verschillende gezondheidsvoordelen te behouden, en richt zich op de vorm en structuur, of morfologie, van olijven, olijfbomen en hun bladeren.

Aan het 3^rd Internationaal symposium over tuinbouw in Europa in Chania, Kreta, half oktober, presenteerde Blazakis het werk dat hij doet in samenwerking met Luciana Baldoni en Marina Bufacchi van de Italiaanse Nationale Onderzoeksraad, Abdelmajid Moukhli van INRA Marrakech in Marokko, en Panagiotis Kalaitzis van MAICh (dat deel uitmaakt van het International Center for Advanced Mediterranean Agronomic Studies).

In een presentatie met de titel ​"Geavanceerde wiskundige algoritmen om olijvenrassen te karakteriseren door middel van morfologische parameters, ”legde Blazakis uit dat zijn ​"De studie beoogt een volledig nieuwe semi-automatische methodologie te presenteren voor het detecteren van verschillende morfologische parameters ”van verschillende olijfcultivars. Zijn methode omvat 5 stappen:

• verzamel monsters van bladeren en fruit: 25 of 30 uit het midden van een boom waarvan de variëteit op een kwekerij is vastgesteld
• beeldgegevens maken: maak er foto's van
• segmentatie: scheid de afbeelding van de bladeren, olijven of zaden van de achtergrond met behulp van wetenschappelijke software
• pas wiskundige algoritmen toe: gebruik MATLAB-software om een ​​reeks instructies te maken met betrekking tot verschillende aspecten van de vorm en structuur van de olijf of het blad, bijvoorbeeld (voor het fruit) gebied, omtrek, hoogte, maximale breedte, positie van maximale breedte, symmetrie of gebrek van symmetrie, ellipsvorm, kromming, tepel
• vertaal resultaten: eindig met getallen die elk aspect van de vorm en structuur van elke olijvencultivar beschrijven

Blazakis zei dat het nodig is om meer tests uit te voeren om er zeker van te zijn dat de morfologische parameters waarmee zijn team werkt onderscheid kunnen maken tussen verschillende cultivars, maar hij gelooft dat ze zullen slagen. Hij voegde eraan toe dat de geautomatiseerde tool die hij aan het ontwikkelen is, een snellere en goedkopere methode zal bieden om een ​​olijvencultivar te bepalen dan DNA-analyse en een nuttige optie zal zijn voor veel boeren die informatie over hun bomen zoeken.

• Bioresources For Oliviculture, of BeFOre Project Description


• III Internationaal symposium over tuinbouw in Europa - SHE2016